Kereta Api yang di berangkatkan dari/berhenti di Stasiun Yogyakarta

Beberapa KA yang diberangkatkan dari/berhenti di Stasiun Yogyakarta

Kelas Eksekutif

• • Argo Dwipangga
  • Argo Lawu
  • Argo Wilis
  • Bima
  • Gajayana
  • Taksaka
  • Turangga

Kelas Eksekutif dan Bisnis

• • Lodaya
  • Sancaka
  • Malabar
  • Malioboro Ekspres

Kelas Bisnis

• • Fajar Utama Yogya
  • Mutiara Selatan
  • Senja Utama Solo
  • Senja Utama Yogya

Kelas Ekonomi AC

• • Bogowonto
  • Gajah Wong

Komuter

• • Prambanan Ekspres
  • Kereta api Madiun Jaya Ekspres
  • Kereta api Madiun Jaya
  • Sriwedari